Plačilo davčnih obveznosti se v eDavkih izvrši le z nekaj kliki in brez izpolnjevanja plačilnega naloga. Pomembna prednost plačevanja davkov preko eDavkov je, da se z enim plačilom lahko plača več različnih obveznosti, ki se sicer plačujejo na različne račune. Zavezanci, ki so v februarju plačali svoje obveznosti preko eDavkov, so zato plačilo svojih obveznosti izvršili s skoraj 5.500 manj plačili.
V eDavkih se spletno plačilo izbranih obveznosti izvrši iz vpogleda eKarticaO preko gumba »ePlačilo za označene« oziroma iz vpogleda »Prejeti dokumenti« preko gumba »ePlačilo«. Na pregledu pripravljenih plačilnih navodil se izbere možnost ePlačilo in nato način plačila. Za zaključek plačila se vnesejo podatki v skladu z navodili plačilnega servisa in potrdi plačilo.
Izvršena spletna plačila je mogoče preveriti tudi v eDavkih na vpogledu ePlačila, kjer so na povezavi »Postavke« na voljo podrobnejši podatki o plačilu in sicer o višini zneska, ki bo razporejen na posamezno izbrano vrsto davka.